Innocence

Po událostech z prvního filmu, majorka Kusanagi Motoko opustila své fyzické tělo a nyní žije jako „duch“ v síti. Její partner Batou však stále pracuje v Sekci 9. Batouovým novým úkolem je vyšetřit sérii sebevražd páchaných na určitém druhu gynoidů - androidů, kteří jsou navržení tak, aby vypadali jako ženy. Spolu s Togusou, Batou jde po stopách gynoidů a celou dobu přemýšlí o tom, že stroje mají nebezpečně blízko k lidem a lidé mají nebezpečně blízko ke strojům.