Kobayashi působil jako obyčejný student na obyčejné střední škole a to až do chvíle, kdy se jednou ráno probudil ve třídě s pilkou v ruce a pod tabulí bylo naaranžováno mrtvé a rozřezané tělo Kobayashiho třídního učitele. A tak se z hlavního hrdiny stal během pár okamžiků hlavní podezřelý z vraždy. Během vyšetřování se Kobayashi seznámil s mladým geniálním detektivem Akechim, který vzbudil jeho zájem. Kobayashi totiž není úplně obyčejný student, ale chlapec s obrovským zájmem o řešení nejrůznějších záhad a stejně jako Akechi zastává názor, že čím je záhada zamotanější a situace bezvýchodnější, tím je vyšetřování větší zábava. Proto se Kobayashi nabídl, že bude dělat Akechimu asistenta. Akechi souhlasí, ale jen pod podmínkou, že Kobayashi vyřeší stávající případ, což se značně zkomplikuje, když na světlo vyjde temné tajemství pana učitele, které Kobayashiho nevinně příliš nenahrává…