Krásná terapistka Chiba Atsuko a geniální vědec Tokita Kosaku pracují pro psycho-medikální institut. Vyrobí zařízení zvané DC-mini. Jedná se o zařízení, které jim umožní vstoupit do pacientova snu a monitorovat tak pacientův vnitřní svět, tímto způsobem se dá vyléčit. Avšak, jednoho dne, je někým toto unikátní zařízení ukradeno. Postupně jsou sny těch, kteří spolupracovali na projektu DC-mini napadány. Atsuko začne vše prošetřovat pomocí svého druhého já. Její druhou osobností je snová detektivka Paprika, která splyne se sny ostatních lidí a tam jim pomáhá odstranit jejich traumata. Paprika se postaví snovým teroristům, kteří používají DC-mini velice silně, tak silně, že mohou zničit lidem jejich osobnosti. Když se sny začnou prolínat s realitou, příběh vstupuje do snů, jaké ještě nikdo neviděl.